• Les évolutions structurelles, techniques et économiques de ces exploitations selon le niveau de production des vaches, entre 2020 et 2024.
• Les pratiques et conduites des élevages commercialisant plus de 10 000 litres par vache et par an.
• Une modélisation de la sensibilité de ces systèmes à la conjoncture.

Ces dernières années, l’augmentation de la productivité par vache s’est accélèrée. Le contexte économique y était favorable mais elle répond aussi à la volonté des éleveurs d’être plus efficace. Sans être représentatif des élevages de l’Ouest, ce dossier décrit l’évolution de 40 exploitations du réseau sur 5 ans. Il différencie les exploitations selon le niveau de production par vache. Tous les élevages ont amélioré leur revenu mais ce sont les élevages les plus productifs à la vache qui ont été les plus bénéficiaires grâce à la productivité par unité de main d’œuvre qui a, elle aussi, augmenté. Ce sont aussi les élevages les plus sensibles à la conjoncture. On observe aussi une robotisation des élevages et une augmentation de la part de culture de vente chez les plus productifs, avec un transfert du temps de travail de l’élevage vers les cultures. Le coût de concentrés s’est dégradé, il est compensé partiellement par une maîtrise de la mécanisation dans les élevages produisant plus de 10 000 litres par vache. Au final, l’efficience globale a régressé mais est plus que compensée par la productivité du travail en conjoncture favorable.

Afin d’analyser les pratiques des troupeaux à haut niveau de production, une enquête a été réalisée pendant l’hiver 2025/2026 auprès de 11 éleveurs. Précision, anticipation et pilotage caractérisent ces élevages. L’alimentation à toutes les étapes de vie de la productrice de lait est un point clé de la conduite animale. Les éleveurs sont aussi attentifs au confort et au bien-être du troupeau. Les choix génétiques ont pour conséquence un résultat d’ISU supérieur de 20 points aux élevages adhérents à Prim’holstein France.

Mise à jour de l'instruction technique relative à l'enregistrement et à la notification des mouvements saisonniers pour les bovins. Consulter

01/10/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

CARTES : Cartes des S-ITAé, des bases locales et souches logicielles IPG - mise à jour octobre 2026. Consulter l'article

08/09/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Repères d'identification des ovins et caprins : Bilan des commandes 2025. Consulter l'article

31/07/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Identification électronique des bovins en France - Etat des lieux au 01/01/2026. Consulter l'article

27/07/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Repères d'identification des bovins : Bilan des commandes 2025. Consulter l'article

08/04/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

CARTES : Cartes des S-ITAé, des bases locales et souches logicielles IPG - mise à jour avril 2026. Consulter l'article

02/03/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

GUIDES PRATIQUES : Mise à disposition des guides Ecopâturage (bovins et ovins-caprins) et du guide de la délégation (ovins-caprins) Consulter l'article

27/02/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

REGLEMENTATION : Instruction technique du 20/02/2026 relative aux modalités d’enregistrement des exploitations et des notifications des mouvements des bovins, ovins et caprins dans le cadre d’une activité d’écopâturage. Consulter l'article

05/02/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

FORMATIONS : Catalogue et Calendrier des formations "Identification et Traçabilité Animale" Consulter l'article

27/01/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

REPERES d'IDENTIFICATION

BOVINS - nouvelle version du cahier des charges de l'agrément (annexe arrêté agrément v1.3 oct 2025). Consulter le document

OVINS et CAPRINS - nouvelle version du cahier des charges de l'agrément (annexe arrêté agrément v2.4 oct 2025). Consulter le document

27/01/2026 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

CARTES : Cartes des S-ITAé, des bases locales et souches logicielles IPG - mise à jour janvier 2026. Consulter l'article

18/11/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Repères d'identification des ovins et caprins : Bilan des commandes 2024. Consulter l'article

08/10/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Instruction technique relative aux modalités d'enregistrement des exploitations et des notifications de mouvement des bovins, ovins et caprins dans le cadre d'une activité d'écopâturage. Consulter l'article

25/08/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Repères d'identification des bovins : Bilan des commandes 2024. Consulter l'article

25/07/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Catalogue et Calendrier des formations "Identification et Traçabilité Animale" Consulter l'article

05/02/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Catalogue et Calendrier des formations "Identification et Traçabilité Animale" Consulter l'article

27/01/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Comment vieillisent les boucles électroniques des petits ruminnants ? Consulter l'article

15/01/2025 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Parution au journal officiel n°0012 du 15 janvier 2025 d’un nouvel arrêté publié le 30 décembre 2024 modifiant l’article 13 de l’arrêté du 6 aout 2013 relatif à l’identification des animaux de l’espèce bovine.

Ce nouvel arrêté a pour objet de réglementer l’identification des bisons. Consulter l'article

26/11/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Agrément des repères : Calendrier des essais de laboratoire 2025. Consulter l'article

22/08/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Pour faire suite à l'obligation d'enregistrer les exploitations saisonières inscrite aux annexes de l'arrêté du 06/08/2013 relatif à l'identification des animaux de l'espèce bovine et de l'arrêté du 30/07/2014 relatif à l'enregistrement des exploitations et des détenteurs, deux instructions techniques ont été publiées au bulletin officiel du ministère de l'agriculture le 19/07/2024.

Ces instructions techniques relatives à l'enregistrement et à la notification des mouvements saisonniers pour les bovins d'une part, et pour les ovins et caprins d'autre part, actent qu'à partir du 31 octobre 2024 :

• les détenteurs bovins doivent notifier tous les mouvements saisonniers des bovins,
• pour les détenteurs ovins caprins, l'obligation de déclaration court jusqu'au 1er avril 2025.

Consulter les instructions techniques et les guides pratiques.

27/07/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Repères d'identification des ovins et caprins : Bilan des commandes 2023. Consulter l'article

01/07/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Identification électronique des bovins - Etat des lieux au 01/01/2024. Consulter l'article

07/06/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

[Enquête] Quelle utilisation de l’identification électronique par les éleveurs des filières ovine et caprine ? Etat des lieux des pratiques en élevage en termes d’utilisation de l’identification électronique. Consulter l'article

26/04/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 

Avec les boucles électroniques, puis l'arrivée des boucles à biopsie en 2016, le matériel d'identification des bovins s'est diversifié durant ces dernières années. Qu'en est-il aujourd'hui de l'usage de ces matériels ? Cet article fait le zoom sur leur déploiement, les fabricants présents et les modèles utilisés en 2023.
Consulter l'article

07/02/2024 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 

Le ministère vient de faire paraître deux nouveaux arrêtés sur l’identification et la traçabilité.

Leurs évolutions majeures portent sur la généralisation de mouvements saisonniers en bovin à toutes les saisons et toutes les zones géographiques. 

L'annexe de l'arrêté du 30 juillet 2014 relatif à l'enregistrement des exploitations et des détenteurs - v1.20

Il définit la notion d’exploitation saisonnière et ses particularités comprend des évolutions sur les points suivants : 
•    La notion d’exploitation de transhumance est remplacée par la notion d’exploitation saisonnières 
•    L’information d’exploitation saisonnière collective ou individuelle est déduite par le nombre de détenteurs qui mettent des animaux sur l’exploitation saisonnière 
•    Cette annexe met également à jour la structure du numéro de détenteur en permettant la présence de lettres pour tenir compte des détenteurs des départements corses (2A et 2B)

Consulter l'annexe 

L'annexe de l'arrêté du 6 août 2013 relatif à l'identification des animaux de l'espèce bovine - v1.30

Il détaille les modalités de notifications des mouvement saisonniers des bovins comprend des évolutions sur les points suivants :
•    Détail les modalités de notifications des mouvement saisonniers des bovins
•    Elargi son périmètre d’action à toutes les saisons et les zones géographiques.
•    Met à jour la table des types raciaux 
•    Met à jour la table des pays de l’Union européenne suite au Brexit.

Conculter l'annexe
 

Au programme :

• Introduction - Françoise Lumale (Ifce)
• Contexte énergétique : 
  • Electricité et carburant - Thomas Gontier (Idele)
  • Gaz - Louis Pimont (Itavi)
• Consommations des élevages par filière : 
  • Ruminants et équins - Thomas Gontier (Idele)
  • Porcs - Yvonnick Rousselière (IFIP)
  • Volailles - Louis Pimont (Itavi)
• Des économies possibles : 
  • Impact de la conception des bâtiments - Frédéric Kergourlay (Chambre d'Agriculture de région Bretagne)
  • Pratiques d’élevage et équipements économes - Frédéric Kergourlay (Chambre d'Agriculture de région Bretagne), Louis Pimont (Itavi), Patrick Massabie et Thomas Gontier (Idele) 
• Autoconsommation photovoltaïque : 
  • Cas concrets dans différentes filières - Pierre Filly (Chambre d'Agriculture de région Bretagne) et Thomas Gontier (Idele) 
  • Stockage de l'énergie avec batteries - Pierre Filly (Chambre d'Agriculture de région Bretagne) et Thomas Gontier (Idele) 
• Conclusion - Frédéric Kergourlay (Chambre d'Agriculture de région Bretagne)

Contact : 

Bertrand FAGOO - bertrand.fagoo@idele.fr

En savoir plus sur le RMT Batice  

Programme et inscriptions en février 2027.

Renseignement : evenement[at]idele.fr

C'est pourquoi un nouveau logiciel, SNP-GWAS, a été développé par les chercheurs INRAE pour réaliser des GWAS au niveau de la séquence, soit pour un très grand nombre de variants bialléliques. Intégrant des fonctionnalités destinées à minimiser les temps de calcul, ce logiciel traite les chromosomes séparément, en parallélisant les analyses de groupes de variants d'un même chromosome. Ce logiciel permet de prendre en compte la structure de la population tout en conservant une taille raisonnable d'équations à résoudre (limitée au nombre de SNP considérés, et ce quel que soit le nombre d'animaux).

De plus, le logiciel intègre quatre fonctionnalités utilisables simultanément, ce qui n'est généralement pas le cas avec les logiciels préexistants :

1. Pondération des performances : si les phénotypes ont des précisions différentes, cette méthode augmente la puissance et réduit le taux de faux positifs ;
2. Prise en compte de l’incertitude des génotypes imputés (cas des animaux analysés grâce à une puce de génotypage) ;
3. Effet de dominance en plus de l'effet additif ;
4. Retrait possible des marqueurs situés sur le même chromosome que le SNP testé afin de maximiser la puissance du test sur un SNP donné.

Un exemple à grande échelle est présenté avec l'analyse de l'âge au premier vêlage de 145 000 vaches de race Montbéliarde et un million de variants.

Le logiciel est accessible gratuitement au lien suivant : https://github.com/thierrytribout/SNP_GWAS

Article complet : https://www.iastatedigitalpress.com/wcgalp/article/23824/galley/22713/view/

Les investigations cliniques, incluant des autopsies et des analyses histologiques, ont révélé une peau extrêmement élastique et fragile présentant des plaies, des cicatrices guéries et des zones anormalement fines, ainsi que des poches séro-hémorragiques. Ces observations étaient cohérentes avec le syndrome d'Ehlers-Danlos, malgré l'absence d'hyperlaxité articulaire.
En se basant sur la structure du pedigree, l'hypothèse d'un mode de transmission dominant avec un mosaïcisme potentiel chez le père a été formulée. Une cartographie par test de déséquilibre de transmission a été réalisée sur les 16 animaux atteints et 113 demi-sœurs témoins génotypés avec la puce SNP Illumina EuroGMD, révélant une région à l'extrémité du chromosome 11. Cette région contenait un gène candidat fort,COL5A1, connu pour causer la forme classique du SED chez l'Homme.
Le génome entier d'un animal atteint a été séquencé et comparé à 1 869 génomes témoins. Après filtrage strict, dix variants hétérozygotes ont été identifiés. Parmi eux, un seul susceptible d’altérer la protéine, une mutation non-sens dans le gène candidat. Le génotypage ultérieur de cette mutation par PCR et séquençage Sanger au sein du pedigree a confirmé l'origine de novo et la causalité probable du variant COL5A1.
Enfin, l'analyse de la distorsion de transmission au sein du groupe témoin nous a permis d'estimer le niveau de mosaïcisme pour cette mutation chez le père à 24,3 %.

En conclusion, nous rapportons la première identification d'une mutation du gène COL5A1 associée au syndrome d'Ehlers-Danlos chez les bovins, présentant des caractéristiques cliniques très similaires à celles décrites précédemment chez l'Homme, à part l'hyper mobilité des articulations. Suite à ces constats, le taureau concerné a été retiré du marché.

Ces travaux ont été financés par APIS-GENE (Effitness).

Article complet : https://www.iastatedigitalpress.com/wcgalp/article/23738/galley/22673/view/

Les variants structuraux ont été détectés chez 176 individus séquencés en lecture longue. Des données de séquençage à lectures courtes, disponibles pour 1 280 individus, ont ensuite été utilisées pour identifier les variants structuraux présents chez ces animaux. Les analyses de validation ont montré une bonne concordance pour les délétions et les insertions, mais une concordance plus faible pour les duplications, qui ont donc été exclues des analyses.

À l'aide d'une stratégie d'imputation en deux étapes, les SNP et les variants structuraux ont ensuite été prédits chez 11 902 taureaux Holstein, 3 753 Montbéliards et 3 053 Normands disposant de phénotypes pour 13 caractères liés à la production laitière, à la santé de la mamelle, à la fertilité et à la stature. Cette approche a permis de disposer, après filtrage, d’environ 14 millions de SNP et 40 000 variants structuraux pour réaliser des analyses d’association à l’échelle du génome (GWAS) dans chacune des trois races.

Les résultats des GWAS étaient cohérents avec des découvertes antérieures et ont identifié 36 associations significatives uniques entre variants structuraux et caractères. Les SNP ont généralement présenté des signaux plus forts dans des régions d'intérêt, probablement en raison de leur meilleure précision d'imputation. Cependant, une insertion de 1 217 paires de bases s’est révélée être le variant le plus significativement associé à une région du génome associé à la stature en race Montbéliarde. Ce variant structural est situé dans un intron du gène GABRG3, qui a notamment été associé à la croissance et à des troubles du développement chez l'Homme.

Dans l'ensemble, nos résultats montrent que l'intégration des variants structuraux dans les études d'association à l'échelle du génome peut apporter un nouvel éclairage sur l'architecture génétique des caractères complexes chez les bovins. Ils soulignent également l’intérêt d'élargir les ressources de séquençage à lectures longues afin d'améliorer la précision d'imputation des variants structuraux et d'augmenter la puissance des futures études d'association.

Ce travail a été réalisé dans le cadre du projet CASCAD, financé par le CARNOT France Futur Élevage (F2E). Les données de séquence ont été produites par les projets FEDER SeqOccIn et H2020 RUMIGEN.

Article complet : https://www.iastatedigitalpress.com/wcgalp/article/23840/galley/22501/view/

Quelques régions génomiques étaient associées de manière significative aux caractères de tolérance au stress thermique ; cependant, ces régions différaient selon la race et le caractère. Au-delà de la mise en évidence de nouvelles régions associées à la tolérance au stress thermique, notre étude a également identifié des QTL ciblant des gènes déjà rapportés dans des études sur la tolérance à la chaleur, soulignant leur pertinence. Enfin, les QTL associés aux pentes (c'est-à-dire à la tolérance au stress thermique) n'étaient pas associés aux niveaux, ce qui suggère qu'une sélection de QTL favorables à la tolérance au stress thermique et sans effets antagonistes sur les caractères actuellement sous sélection est possible.

Cette étude a reçu un financement du programme de recherche et d'innovation Horizon 2020 de l'Union européenne sous le numéro de subvention 101000226 (Rumigen) et d'APIS-GENE (CAICalor). Les auteurs remercient Météo-France pour la base de données Safran.

Article complet : https://www.iastatedigitalpress.com/wcgalp/article/23817/galley/22701/view/