CANIGENA : vers un programme de sélection génomique pour les chiens de conduite de troupeau à usage professionnel en ferme (2024-2027)

Le chien de conduite de troupeau (CCT) est aujourd’hui un partenaire de travail précieux des éleveurs d’animaux de rente (bovins, ovins, caprins, etc.) : il leur apporte de l’efficacité (en leur permettant d’être autonomes et de gagner du temps), de la sécurité (en rendant leurs animaux plus dociles) et du confort (en réduisant leurs efforts physiques et leur stress qui peut être généré lors des manipulations de leurs animaux), en plus d’être un compagnon au quotidien. L’utilisation d’un CCT résulte d’un subtil équilibre entre ses aptitudes naturelles (sa génétique, l’inné) et son dressage (l’acquis, délivré par son maître), dont la proportion n’est pas encore identifiée. Tous les chiens, même s’ils sont issus de races prédisposées pour conduire les troupeaux (Border-Collie, Beauceron, Berger des Pyrénées), n’ont pas les mêmes aptitudes naturelles. Certains ont des aptitudes très limitées malgré leur race bergère alors que d’autres présentent l’intérêt de nécessiter moins de compétences de la part de l’utilisateur pour être dressés, grâce à leurs séquences comportementales spontanées en adéquation avec le comportement des animaux manipulés : ces chiens sont dits “à valeur d’usage recherchée”.

Face à l’enjeu de sécuriser le choix du chien, son dressage et son utilisation par les éleveurs (rentabilité de l’investissement), une étude (projet CANIDEA Idele ), menée entre 2019 et 2023 et financée par l’Institut Carnot, a permis de définir un test d’évaluation des aptitudes naturelles d’un CCT, simple, fiable et répétable ainsi que sa grille de notation, et d’identifier les critères comportementaux discriminant les CCT à valeur d’usage recherchée. La cohorte importante de chiens testés - 536 chiens, dont 460 de race Border-Collie - reste néanmoins insuffisante pour procéder à une évaluation génomique, les caractères comportementaux étant généralement peu héritables.

Ainsi, le projet CANIGENA a pour objectif d’étudier la faisabilité de mettre en place un programme de sélection génomique pour les chiens de conduite de troupeau (CCT) à usage professionnel, inspiré des modèles ruminants. A terme, ce programme de sélection, s’il s’avère réalisable et intéressant pour les acteurs, doit permettre de faciliter la diffusion d’une génétique de CCT adaptée au travail en ferme. 

Il est structuré autour de 5 actions.