Conséquences de l'utilisation de corrélations génétiques spécifiques à chaque individu sur le classement et les paramètres de covariance génétique des candidats à la sélection

Dans les programmes de sélection, les corrélations génétiques entre les caractères sont considérées identiques pour tous les individus pris en compte dans une évaluation génétique. Cette utilisation des corrélations génétiques comme paramètres définissant la distribution multivariée des valeurs génétiques (VG), pris en compte dans la construction de l'index de synthèse unique (ISU), s'est avérée très efficace pour garantir un progrès génétique pour de nombreux caractères, tout en gérant, lorsqu'ils existent, les compromis. Cependant, comme les corrélations génétiques dépendent fortement de l'architecture des caractères concernés et du génotype de chaque individu, différents individus peuvent présenter un potentiel différent pour les corrélations génétiques. Lorsque très peu de données phénotypiques sont disponibles par individu, les méthodes statistiques nous empêchent d'estimer correctement les corrélations génétiques spécifiques à chaque individu (iSGC). Cependant, dans les populations où certains individus ont un grand nombre de descendants, comme les vaches laitières, les iSGC peuvent être obtenues pour les taureaux sous forme de corrélation entre la VG de leurs filles, corrigée de la VG maternelle.

Deux caractères ont été simulés avec des héritabilités de 0,3 et 0,01, avec une corrélation génétique de -0,2, et les iSGC ont été calculées à partir de plusieurs gamètes simulés par individu. Deux ISU avec des pondérations économiques de 0,75 et 0,25 pour les caractères 1 et 2 respectivement ont été construits : ISU_par avec une corrélation génétique de -0,2 pour tous les individus, et ISU_CGSi avec les iSGC de chaque individu, ce qui a donné des classements modérément différents parmi le top 20 % des meilleurs taureaux. De plus, le top 20 % des taureaux sélectionnés sur ISU_iSGC présentaient une variance génétique plus importante que le top % 20 % des taureaux sélectionnés sur ISU_par, ainsi qu'une corrélation génétique négative moins élevée entre les deux caractères.

Ces résultats suggèrent que la sélection basée sur ISU_iSGC peut permettre d'obtenir des progrès génétiques équivalents pour les caractères d'intérêt, tout en conservant une plus grande diversité génétique et en maitrisant mieux le compromis entre les caractères antagonistes.