Comment les ressources génétiques cryoconservées peuvent-elles être utilisées dans les populations animales domestiques ?
La diversité génétique est essentielle à l'adaptation des populations animales et constitue donc un pilier central de la transition agroécologique. Cependant, une partie de cette variabilité génétique est inévitablement perdue au sein des populations et des efforts sont nécessaires pour limiter ce phénomène. Dans ce contexte, l'utilisation de ressources génétiques ex situ, c'est-à-dire de semences cryoconservées dans des banques de gènes, pourrait être un outil de gestion précieux pour maintenir ou restaurer la diversité génétique.
Notre étude vise donc à évaluer la valeur des ressources génétiques ex situ pour gérer la diversité génétique dans les populations soumises à des programmes de sélection contrastés, afin de formuler des recommandations pour leur utilisation efficace.
Nous avons utilisé des simulations (programme MoBPS) de populations animales sélectionnées ou non, et soumises ou non à un programme de conservation. La sélection ciblait deux caractères négativement corrélés et a été simulée de manière à maximiser soit les valeurs génétiques, soit la diversité génétique, en utilisant l'OCS pour optimiser l'utilisation des ressources génétiques ex situ.
Nous montrons que l'utilisation appropriée des ressources génétiques ex situ changeait radicalement en fonction des caractéristiques de la population cible et de ses objectifs de sélection. Pour les populations conservées, l'utilisation régulière de nombreux reproducteurs cryoconservés a contribué à maintenir la diversité génétique à travers les générations, ralentissant ainsi l'augmentation de la consanguinité. Pour les populations soumises à la sélection, la stratégie dépendait des objectifs de sélection : lorsque le progrès génétique était prioritaire, l'utilisation occasionnelle de quelques reproducteurs cryoconservés augmentait la variance génétique, permettant une sélection durable. Cependant, pour les populations dont l'objectif de sélection avait fortement changé, l'utilisation de reproducteurs anciens s'est avérée pertinente à condition d'être gérée avec soin afin d'éviter une diminution de la valeur génétique pour les caractères clés.
Cette étude met en évidence le potentiel stratégique des ressources génétiques cryoconservées pour la gestion de la diversité génétique et le progrès génétique. Cependant, l'utilisation de ressources cryoconservées dans les populations animales nécessite une grande quantité de matériel, pour les races sélectionnées, car le nombre de descendants est élevé, et pour les races conservées, car les semences congelées de nombreux reproducteurs sont utilisées de manière répétée sur une longue période. Par conséquent, les banques de gènes devraient conserver un large choix de matériel afin de soutenir efficacement l’élevage des populations animales.
Pour aller plus loin, retrouvez ici un article sur la thématique des ressources génétiques cryoconservées.
