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Projet Morpho3D : Phénotypage morphologique par imagerie 3D en production bovine

Publié le par Clément Allain (Institut de l'Elevage), Philippe Faverdin (Agrocampus Ouest), Yannick Le Cozler (Agrocampus Ouest), Jean-Michel Delouard (3D Ouest), Laurent Delattre (3D Ouest)
Automatisme et capteurs Performances et phénotypes Equipements d'élevage Bovin lait Bovin viande
Développer un dispositif de phénotypage à haut débit permettant l'acquisition et le traitement d'images 3D complètes de bovins adultes ou en croissance, tel est l'objectif principal du projet Morpho3D.

 

Le projet Morpho3D se positionne dans un contexte de très forte demande en dispositifs de phénotypage animal à haut débit. L’opportunité offerte par les nouvelles technologies doit permettre à l’élevage de relever ce challenge à moindre coût, sur de grands effectifs et sans perturber les animaux (méthodes non invasives).

 

Objectifs

Le projet Morpho3D vise à développer un dispositif de phénotypage à haut débit permettant l’acquisition et le traitement d’images 3D complètes de bovins adultes ou en croissance. Pour cela, il s’appuiera sur les progrès récents réalisés par l’imagerie 3D permettant de réaliser des mesures rapides, précises, répétables et stockables de caractères morphologiques complexes (volumes, surfaces, mensurations, postures,…), difficilement mesurables par d’autres moyens.

Les objectifs opérationnels de ce projet de 18 mois sont donc de :

  • Développer un dispositif d’acquisition et une méthode de traitement de l’image 3D d’un animal entier vivant, ce qui sera une première pour des animaux de ce gabarit.
  • Réaliser des premières mesures de validation des vaches laitières.

 

Dispositif d’étude

Action 1 : Mise au point d’une image 3D d’un animal complet

Cette action vise à développer un dispositif d’acquisition et une méthode de traitement de l’image 3D d’un animal entier vivant. Cela sera réalisé en 3 temps :

  • (1) la mise au point de l’appareillage prototype pour une prise d’image en laboratoire 
  • (2) la conception de la structure définitive pour une prise d’image dans des conditions réelles et  
  • (3) la mise au point et validation d’un traitement logiciel permettant de générer la forme 3D et d’en extraire des mesures.

 

Voir les résultats de cette action.

 

Action 2 : Test et validation du dispositif

L’objectif de l’action est :

  • de réaliser des premières mesures de validation sur des bovins,
  • d’effectuer des tests de répétabilité des mesures réalisées sur les animaux,
  • de faire le lien avec des méthodes plus classiques d’étude de la morphologie.
  • Il permettra également de faire les premières mesures liés à des phénotypes plus originaux (angles, surfaces, volumes) et de les relier à d’autres phénotypes mesurés dans des conditions expérimentales.

 

Ceci sera réalisé dans les installations expérimentales de l’INRA de Méjusseaume (Le Rheu, 35).

 

Voir les résultats de cette action.

 

Action 3 : coordination et valorisation des acquis du projet

Cette action visera à organiser le projet et à transférer les résultats issus du projet vers un large public : les éleveurs et leurs conseillers, les constructeurs et distributeurs de capteurs ainsi que l’enseignement et la recherche.

 

Partenaires

Partenaires principaux

Institut de l’élevage

INRA - UMR PEGASE

Agrocampus Ouest - UMR PEGASE

3D Ouest

Autres partenaires techniques

France Conseil Elevage

INRA UMR H

INRA UMR GABI

 

Ce projet est porté par l’UMT RIEL (Recherche et Ingénierie en Elevage Laitier)

 

Calendrier

Janvier 2016 – Décembre 2017

 

Financeur

Le projet Morpho3D est financé dans le cadre du programme CASDAR Recherche Technologique.

 

Contacts

 

Institut de l'élevageINRA3D Ouest

Clément Allain

Chef de Projet élevage de précision

Tél : 02 99 14 89 52

Mel : clement.allain@idele.fr
Philippe Faverdin

Directeur de Recherche

Tel : 02 23 48 50 95

Mel : Philippe.faverdin@rennes.inra.fr

Jean-Michel Delouard

Gérant

Tel : 02 96 48 68 19

Mel : delouard@3douest.com