La paratuberculose chez les petits ruminants |
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La paratuberculose chez les petits ruminants |
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La paratuberculose est une maladie enzootique contagieuse des ruminants à l'origine de pertes économiques importantes. Des travaux ont été conduits pour proposer un diagnostic de troupeau à moindre coût sur lequel s'appuyer pour orienter la prise de décision dans les plans de maitrise et de prévention
La paratuberculose est une maladie enzootique contagieuse des ruminants due à Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (Map), à l'origine de pertes économiques importantes.
Dans les troupeaux ovins et caprins, les grands effectifs et la faible valeur économique des animaux limitent l'utilisation de tests de dépistage individuels à grande échelle. Les faibles valeurs prédictives des tests diagnostiques ne permettent par ailleurs pas de définir un statut sanitaire sur la base d’un petit nombre d’animaux. De ce fait, le statut sanitaire des troupeaux est très mal connu.
Il apparait donc important de développer des approches diagnostiques à l’échelle collective à moindre coût, permettant d'évaluer la situation sanitaire globale des troupeaux (infectés ou à faible risque de l'être) voire de préciser la prévalence intra-troupeau de l'infection, afin de mieux orienter la prise de décision dans les plans de maitrise et de prévention.
Le but de notre étude était d'évaluer la sensibilité et la spécificité à l’échelle des troupeaux de la qPCR sur fèces et de la sérologie ELISA sérique appliquées à des mélanges d’échantillons pour le dépistage de la paratuberculose dans les troupeaux ovins français.
Des résultats bruts...
Les résultats indiquent que les mélanges de fèces contenant au moins un échantillon avec une forte charge bactérienne (Ct faible) étaient invariablement détectés quelle que soit la taille du mélange (5, 10 ou 20). Inversement, les mélanges contenant un seul échantillon avec une faible charge bactérienne (Ct élevé) étaient associés à un taux de détection plus faible : 87,0 % à 90,0 % pour les mélanges de taille 5, 63,0 % à 70,7 % pour les mélanges de taille 10 et 46,7 % à 60,0 % pour les mélanges de taille 20.
Après modification du seuil de décision pour les mélanges de 5 ou 10 sérums, la sensibilité relative de la sérologie ELISA variait de 62,2 % et 100,0 % selon la composition des mélanges, pour une spécificité relative de 100%.
... A l'analyse des performances de stratégies de dépistage
Enfin, en combinant ces résultats et les performances diagnostiques de la qPCR et de la sérologie ELISA à l’échelle individuelle, une étude par simulation a été réalisée pour évaluer les performances de 16 stratégies de dépistage à l’échelle des troupeaux, différant selon la taille (5,10 ou 20) et le nombre (5 à 60) de mélanges analysés.
La qPCR appliquée à des mélanges de fèces apparait comme une alternative prometteuse pour la surveillance et le dépistage à moindre coût des troupeaux ovins infectés par la paratuberculose. Par ailleurs, contrairement à la sérologie ELISA, son utilisation est envisageable même en cas de vaccination, afin de suivre l’évolution du statut épidémiologique des troupeaux.
Travaux conduits par Yoann Mathevon, Gilles Foucras et Fabien Corbière (UMR INRA ENVT 1225 IHAP, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Toulouse Cedex, France)
Article publié dans PLos One 2019 Dec 26;14(12):e0226246.
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0226246
Fabien Corbière (ENV Toulouse), Gilles Foucras (ENV Toulouse), Renée de Crémoux (Institut de l'Elevage)
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